Ochrona gatunkowa dotyczy najcenniejszych, unikatowych i rzadkich przedstawicieli flory i fauny.

Na terenie Nadleśnictwa Kluczbork, w oparciu o Rozporządzenie Ministra Środowiska z dnia 9 października 2014r. w sprawie ochrony gatunkowej roślin
stwierdzono występowanie 7 gatunków podlegających ochronie. Są to:

• Wawrzynek wilczełyko Daphne mezereum
• Bagno zwyczajne - Ledum palustre
• Widłak jałowcowaty - Lycopodium annotinum
• Kruszczyk szerokolistny - Epipactis helleborine
• Torfowiec - Sphagnum sp.
• Widłak goździsty - Lycopodium clavatum
• Bielistka siwa - Leucobryum glaucum
• Fałdownik nastroszony - Rhytidiadelphus squarrosum
• Gajnik lśniący - Hylocomium splendens
• Rokietnik pospolity - Pleurozium schreberi
• Widłoząb kędzierzawy - Dicranum polysetum
• Widłoząb miotłowy - Dicranum scoparium

Na terenie Nadleśnictwa występuje również wiele gatunków owadów, ptaków, ssaków i innych:

 Owady
• Biegacze - Carabus
• Tęczniki - Calosoma
• Trzmiele - Bombus
• Kozioróg dębosz - Cerambyx Cerdo
• Czerwończyk nieparek - Lycaena dispar

 Mięczaki
• Slimak winniczek - Helix pomatia
 

 Płazy
• Kumak nizinny – Bombina bombina
• Ropuchy - Bufo
• Żaby - Rana

 Gady
• Jaszczurka zwinka - Lacerta agilis
• Padalec zwyczajny - Anquis fragilis
• Zaskroniec zwyczajny - Natrix natrix
• Zmija zygzakowata - Vipera berus

 Ptaki
• Bocian biały - Ciconia ciconia
• Cierniówka - Sylvia communis
• Czyżyk - Carduelis spinus
• Drozd śpiewak - Turdus philomelos
• Dzięcioł czarny - Dryocopus martius
• Dzięcioł duży - Dryocopus major
• Dzięcioł średni - Dryocopus medius
• Dzięcioł mały - Dryocopus minor
• Dzwoniec - Carduelis chloris
• Gawron - Corvus frugilegus
• Gil - Pyrrhula pyrrhula
• Jastrząb - Accipiter gentilis
• Jerzyk - Apus apus
• Kos - Turdus merula

• Kania ruda - Milvus milvus
• Kruk - Corvus corax
• Kukułka - Cuculus canorus
• Mazurek  - Passer montanus
• Muchołówka szara - Ficedula strata
• Myszołów zwyczajny - Buteo buteo
• Pokrzewka ogrodowa - Sylvia borin
• Sierpówka - Streptopelia decaocto
• Sikora bogatka - Parus major
• Sikora czubatka - Parus cristatus
• Sikora modra - Parus caeruleus
• Sikora sosnówka - Parus ater
• Sikora uboga - Parus palustris
• Gołąb siniak - Columba oenas
• Skowronek polny - Alauda arvensis
• Sójka - Garrulus glandarius
• Sroka - Pica pica
• Szczygieł - Carduelis carduelis
• Szpak - Sturnus vulgaris
• Trznadel - Emberiza citrinella
• Wilga - Oriolus oriolus
• Wrona - Corvus corone cornix
• Wróbel domowy - Passer domesticus
• Zięba - Fringilla coelebs
• Żuraw - Grus grus
• Bielik - Haliaetus albicilla
• Sóweczka - Glaucidium passerinum

 Ssaki
• Jeże - Erinaceus
• Kret - Talpa europaea
• Wiewiórka - Sciurus vulgaris
• Ryjówkowate - Soricidae
• Łasica łaska - Mustella nivalis
• Wydra – Lutra lutra
• Bóbr europejski – Castor fiber

• Koszatka leśna - Dryomys nitedula

Ochrona strefowa gatunków chronionych

Na terenie Nadleśnictwa Kluczbork Decyzją Regionalnego Dyrektora Ochrony Środowiska w Opolu ustalono strefy ochrony ostoi, miejsc rozrodu i regularnego przebywania wokół gniazd ptaków objętych ochroną. Są to:

1. Kania ruda (Milvus milvus)
2. Bielik (Haliaetus albicilla)
3. Sóweczka (Glaucidium passerinum)